原名浔甸,其意为积水之甸。1912年以多水患,故众议删去水点,改为寻甸。又据《寻甸府志》:“古滇国地,昔僰刺蛮居之,无郡县,其部曰仲札溢源。后乌蛮新丁夺而有之,至四世孙,因其祖名新丁,以为部号,名新丁语,语讹为仁地部。到唐蒙氏为寻甸部。”
1913年设寻甸县。1998年12月6日,国务院批准将曲靖市管辖的寻甸回族彝族自治县划归昆明市管辖。
2000年,寻甸回族彝族自治县辖6个镇、11个乡。
根据第五次人口普查数据:全县总人口481721人,其中各乡镇人口(人): 仁德镇 20820 塘子镇 27617 羊街镇 41442 柯渡镇 32820 倘甸镇 39695 功山镇 39256 河口乡 32925 七星乡 17678 城关乡 33093 金所乡 34586 先锋乡 20021 六哨乡 17227 鸡街乡 30810 风仪乡 36842 联合乡 12262 金源乡 26999 甸沙乡 17628
2001年,全县辖6个镇、11个乡:仁德镇、塘子镇、羊街镇、柯渡镇、倘甸镇、功山镇、河口乡、七星乡、城关乡、金所乡、先锋乡、六哨乡、鸡街乡、凤仪乡、联合乡、金源乡、甸沙乡。
2006年,撤销仁德镇和城关乡,设立新的仁德镇,新设立的仁德镇管辖原仁德镇和城关乡管辖的行政区域范围,镇政府驻原城关乡政府驻地。
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